上海奔普仪器科技有限公司
安全检测仪器 | 计量检测仪器 | 暖通环保仪器 | 无损检测仪器 | 设备诊断仪器 | 电子测试仪器 | 电工测试仪器 | 水质分析仪器 | 气体检测仪器 | 过程校验仪器 |

美研制出将基因序列转译成图像的新工具

http://www.17360.cn
标签TAG:
浏览 次【字号 】 发布时间:2012-7-1 打印本页
美研制出将基因序列转译成图像的新工具         美国科学家开发出一个可将DNA序列转译成图像的新工具,这将有助于鉴别导致癌症、亨廷顿氏症以及其他遗传疾病的DNA图谱的实时变化,从而使研究人员能更迅速、更有效地区分遗传模式。

北卡罗来纳州立大学计算机科学系博士生戴维·考克斯设计的这个“符号散点图”工具,给DNA序列提供了一个可视化的示意图。考克斯解释说,与现存的那些试图找出重复DNA序列的计算机程序相比,人类的视觉系统更善于识别图样,并在图样之间进行区分。换言之,肉眼看图的能力目前要强于计算机。

确定DNA序列中的图样是很重要的,因为它能帮助研究人员在癌症等疾病患者和健康人之间鉴别实时的基因变异。改进相关DNA序列的鉴别力,将有望加快开发出各种疾病的更成功的治疗方法,并允许研究人员将重点放在和疾病相关的部分DNA上,使人们增强对这些疾病遗传机制的了解。譬如,到底是什么打开或关闭了某个特定基因?

那么,符号散点图工具是如何创建DNA的可视化示意图的呢?DNA由4种核苷酸组成,分别用字母A、T、G和C表示,这些核苷酸的每三个字母串,如AAA或ATG等称为3基体(3-mers)。考克斯解释说,有64种3基体,每个3基体用数字0至63来表示。符号散点图工具将用一个很长的字符串来表示DNA序列,并将其以一个个的3基体形式分开。为每个3基体画一个点,将数字0至63作为Y轴。X轴则代表3基体出现在基因序列中的顺序。由此产生的散点图就可揭示原始DNA中的有趣图样。将这些散点串在一起就能制成动画用来比较DNA序列。

考克斯选择3基体的原因是其与密码子相关,密码子是人体在生产蛋白质过程中插入一个特定氨基酸所用的遗传代码。换句话说,他们监督蛋白质(人体基本构建模块)的产生。

考克斯说,尽管3基体有64个,但只有20个氨基酸,所以每个氨基酸对应3个多一点的3基体。考克斯设计的这个符号散点图可使这些对应相应氨基酸的3基体能够彼此相邻。如此一来,就很容易判断何时3基体中的一个出现明显差异,即从一个氨基酸变成了另一个氨基酸。

本文网址:http://www.17360.cn/News/ZiXunView-113.html
上一条:仪器仪表发展迅速 教育领域应用广泛 下一条:我国食品药品安全仍处于风险高发期和矛盾凸显期
    
奔普仪器| 联系我们 | 订单查询 | 付款方式 | 留言或建议 | 关于我们
 客服邮箱:tech17@126.com 客服电话:021-31266107 邮政编码:201199
 公司地址:上海市沁春路1366弄38号803室 网站地址:www.17360.cn
 Copyright © 2005-2014 上海奔普仪器科技有限公司 All Rights Reserved.

网站备案:沪ICP备05008086号
销售区域:北京-上海-江苏-浙江-天津-山东-河南-河北-安徽-江西-福建-湖南-广东-广西-湖北-重庆-辽宁-吉林-山西-四川-云南-贵州-陕西-西藏-新疆-青海-甘萧-南京-常州-无锡-苏州-镇江-扬州-南通-湖州-昆山-嘉兴-宁波-杭州-温州-合肥-福州-厦门-南昌-武汉-长沙-成都-黑龙江-内蒙古等全国各地.